Cette année, JOBIM2026 pose ses valises à Strasbourg !

Vous êtes 497 inscrits en présentiel et 100 en distanciel. La SFBI et les comités d’organisation et de programme sont heureux que la communauté soit au rendez-vous, comme chaque année.

La conférence débutera le mardi 30 juin à 13h15. Vous pouvez retrouver le programme en ligne dès à présent avec la liste des orateurs et oratrices invités mais aussi la liste des mini-symposia, ainsi que les activités sociales.

Nous vous souhaitons une excellente conférence et au plaisir de vous rencontrer !

Cette année encore, JeBIF prépare son workshop annuel “JeBIF@JOBIM” qui aura lieu le lundi 29 juin 2026, et qui s’intéressera particulièrement à la place des jeunes bioinfos dans le monde professionnel.
Workshop des JeBIF@JOBIM 2026
Au programme :

• Une matinée dédiée à la professionnalisation, avec des interventions d'acteurs majeurs de la bioinformatique française et une table ronde réunissant des représentant·es du monde académique (SFBI, IFB) et industriel (Transgene, Starfish Bioscience).

• Une après-midi d'échanges et de discussions sur leur jeune réseau professionnel, ponctuée d'activités conviviales et d'un mini-symposium où les participant-es pourront partager leurs premières expériences professionnelles (stages, salariat, entrepreneuriat, etc.).

Des places sont encore disponibles, alors ne manquez pas de vous inscrire

La matinée sera retransmise en direct sur YouTube et Twitch pour permettre à celles et ceux ne pouvant se déplacer d’y participer.

Pour plus d’informations sur cet évènement, rejoignez nous sur Discord et LinkedIn

Du 30 juin au 3 juillet 2026, retrouvez l’unité coordinatrice IFB-core, les plateformes membres et les plateformes/équipes associées de l’IFB/ELIXIR-FR à JOBIM ! Au programme : posters, démo, mini-symposium… Vous pourrez également échanger avec nous sur le stand IFB !
Stand IFB à JOBIM 2025

Nous serons à JOBIM pour la 3ème année consécutive, n'hésitez pas à venir nous écouter le mercredi après-midi de la conférence lors de la présentation des différents réseaux français.

Un retour de l'enquête sur les conditions de travail des bioinformaticiens•nes, réalisée en collaboration avec la SFBI, sera au programme à cette occasion. Une synthèse des résultats de cette enquête sera présentée sous forme d'un poster affiché tout au long de la conférence.

Par ailleurs, durant JOBIM, le GT-Annotation de MERIT co-organise avec le réseau INRAE PEPI IBIS, la SFBI et l’IFB, le mini-symposium "L’annotation structurale des gènes dans les génomes eucaryotes est-elle toujours une problématique ?" qui se déroulera le jeudi 2 juillet après-midi.

N'hésitez pas à venir nous rencontrer, tout au long de ces 4 jours de conférence !

La SFBI sera bien entendu présente aux JOBIM à Strasbourg. Vous pourrez nous retrouver sur le stand SFBI tout au long de la conférence afin de nous poser toutes vos questions.

En amont des JOBIM, la SFBI organise l'édition 2026 des Rencontres autour de l'Enseignement en BioInformatique en France (REBIF2026) les 29 & 30 juin. Pour en savoir plus.

Durant les JOBIM, la SFBI co-organise le 1er mini-symposium "Interactions internationales en bioinformatique" qui se déroulera le jeudi 2 juillet. Les communautés bioinformatiques d'Afrique de l'Ouest et du Brésil seront mises à l'honneur. Pour en savoir plus.

Comme chaque année, la SFBI présentera son bilan annuel à la communauté lors de son assemblée générale qui se déroulera le mercredi 1er juillet à 14h30, avant la session dédiée aux réseaux en bioinformatique. Les membres du bureau pour lesquels les adhérents de la SFBI peuvent voter jusqu'au 30 juin 23h59 vous seront également présentés. On compte sur votre présence !

La 4ème édition de l'école (JC)²BiMMM s'est tenue du 1er au 5 juin à Forges-les-Eaux. Les 23 participant·e·s et 11 intervenant·e·s ont affronté dans la joie et la bonne humeur une météo et un réseau capricieux pour découvrir ensemble les fondements statistiques, algorithmiques et combinatoires pour l'analyse des données de séquences. Au programme, du très sérieux avec l'analyse différentielle, les k-mers, l'intégration de données, l'alignement et l'assemblage, la segmentation, le sketching et un peu de pangénome et d'IA pour les données omiques. Mais aussi du social qui crée des liens avec une session de médiation scientifique, une faille temporelle, beaucoup de jeux de mots et un chaton abandonné qui a trouvé un foyer. Merci à toutes les personnes qui ont contribué à la réussite de l'école !

Photo de groupe de l'école (JC)²BiMMM

L'activité du GdR marquera le pas durant la pause estivale pour mieux reprendre à la rentrée avec les manifestations des 20 ans du 14 au 16 octobre. Les réjouissances commenceront le 14 à l'IHP avec la journée JCJC dans le cadre de l'année thématique l'ADN dans tous ses états avant de se poursuivre de l'autre côté de la rue de à l'ENS les 15 et 16. Les inscriptions sont désormais ouvertes et le programme s'annonce déjà passionnant avec des exposés panorama données entre autres par Claire Lemaitre (algorithmique des séquences), Lucie Bittner (écologie et environnement), Anaïs Baudot (intégration de données multi-omiques) et Laurent Jacob (machine learning pour la génomique).

JeBIF – avec le soutien de la SFBI et du comité local d’organisation des JOBIM – renouvelle le JobFair cette année.

C’est une occasion unique pour les jeunes bioinfos et les professionnel-les du domaine, d’échanger ensemble pendant les JOBIM pour s’informer sur les besoins de recrutement des structures publiques et privées, et partager le quotidien (très variable) du métier de bioinformaticien-ne.

Cette année, les participant-es au JobFair ont pu s’inscrire directement via le formulaire d’inscription à JOBIM, et vous avez été plus d’une centaine à manifester votre intérêt pour cet événement. Nous vous remercions sincèrement pour ce grand engouement.

Les places disponibles pour cet événement étant limitées, nous ne pourrons pas accueillir l’ensemble des inscrit-es (comme indiqué sur le formulaire d’inscription). Préparez-vous donc à être contacté-e par JeBIF et par mail prochainement, pour en savoir plus sur l’état de votre inscription.

GT-Intégration : des données hétérogènes - prochain webinaire le mardi 7 juillet à 10h avec deux présentations de Vincent Le Goff et Mary Savino du CNRGH

GT- AI : le 12 juin prochain se déroulera à Paris la deuxième journée IA pour le développement logiciel et l'analyse de données biologiques, co-organisée avec l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’Université Paris Cité (iPOP-UP et DU omiques).

GT-FAIR et Reproductibilité : le 27 Mai 2026, Julien Seiler (IFB-Core) a présenté "Pixi: Package Management Made Easy" lors d'un webinaire. Les supports sont disponibles sur la page du GT.

GT-Annotation : le 15 avril 2026 : Sébastien Aubourg (IRHS, INRAE Angers) a présenté un webinaire portant sur la problématique de l'analyse des petits peptides, impliqués notamment dans les réponses immunitaires des plantes , à partir de données génomiques : "Annotation des petits peptides sécrétés : quels défis ?

GT-Single cell et transcriptomique spatiale : le 22 mai 2026, Léopold Guyot et Loïc Guille nous ont proposé une démo sur une interface graphique pour l’analyse de données de single-cell proteomics appelé QFeaturesGUI, le support est disponible sur la page du GT.

Participation financière:

BIOTIC : Le 21 mai dernier, la journée annuelle du réseau local Marseillais BIOTIC (https://biotic.univ-amu.fr/fr/node/210) a eu lieu. L’événement a une nouvelle fois rencontré un franc succès, rassemblant plus de 100 participants issus d’une vingtaine de laboratoires différents. Cette nouvelle journée a permis d’explorer plusieurs thématiques, notamment la modélisation des enhancers et des réseaux de régulation génique à l’aide de l’intelligence artificielle (S. Aerts), l’utilisabilité des outils bioinformatiques à travers un cas concret d’analyse en scRNA-seq, ainsi que des pistes pour améliorer leur évaluation (C. Herrmann), et enfin les approches computationnelles et multi-omiques pour étudier l’adaptation des mitochondries à leur environnement cellulaire (B. Habermann).

MBI (réseau Montpelliérain de Bioinformatique): MERIT a soutenu financièrement la tenue d'un atelier Nextflow pour les débutants au mois de Mars 2026. La journée s’est déroulée sur environ 7 heures, alternant entre sessions théoriques et exercices pratiques. L’ensemble des supports et ressources de l’atelier est disponible à l’adresse suivante :
Textehttps://gitlab.in2p3.fr/ighbioinfo/mbi-nextflow

À l’ère de l’explosion des données en sciences de la vie et de la santé, savoir utiliser Unix est désormais indispensable aux chercheur·ses et aux étudiant·es en biologie. Pourtant, cet apprentissage reste un défi pour beaucoup, par manque de référentiel de ce qui est nécessaire d’apprendre spécifiquement pour la biologie, mais surtout du fait des barrières techniques (installation de logiciels, accès aux infrastructures, etc.). Pour répondre à ce besoin, le groupe e-formation de l’IFB/ELIXIR-FR a développé une approche pédagogique innovante autour de parcours d’apprentissage adaptés et progressifs ainsi que des tutoriels interactifs en ligne, réalisés en partenariat avec un développeur canadien. Pour en savoir plus

La SFBI a reçu 16 demandes de bourse de voyage pour la conférence JOBIM2026 ! Nous sommes heureux de voir que vous avez été nombreuses et nombreux à répondre à cet appel.

Comme nous l'avions annoncé, la SFBI a pu en financer 10 d'entre elles afin que stagiaire, doctorant·e, ingénieur·e, post-doctorant·e, ... puissent se rendre à la conférence afin de présenter leurs travaux.

Pour cette année, l'appel est clos mais nous reviendrons l'année prochaine pour JOBIM2027 à ... (et non, il va falloir patienter encore un peu pour connaître la destination 2027 !).

Les demandes de bourse de garde d'enfants sont quant à elle ouvertes tout au long de l'année. Cependant vos demandes doivent nous être transmises avant le début de la conférence.

Les bourses de voyage pour les autres conférences ainsi que les bourses pour l'organisation d'événements scientifiques restent également ouvertes tout au long de l'année alors n'hésitez plus et rendez-vous sur https://www.sfbi.fr/ dans la rubrique "Bourses/Prix" pour en savoir plus.

Avec l'arrivée des beaux jours, huit JeBiF PUBs ont été organisés ou sont en cours d'organisation partout en France grâce à l'implication des bénévoles de l'association.

Un grand merci à toutes les personnes ayant contribué à ces événements, ainsi qu'aux nombreux·ses participant·e·s !

Les JeBiF PUBs du printemps :

• Paris – 15 avril et 26 mai
• Nantes – 19 mai
• Marseille – 29 mai
• Montpellier – 9 juin

Les prochains rendez-vous :

• Rouen – 12 juin, en collaboration avec les étudiant-e-s du Master de Bioinformatique de l'Université de Rouen
• Bordeaux – 19 juin
• Strasbourg – 29 juin, en amont de JOBIM 2026

Nous espérons vous voir nombreux·ses lors de ces prochains moments d'échange et de convivialité !

Du 7 au 11 avril 2026, l’équipe formation de l’IFB/ELIXIR-FR a organisé la dernière édition de la formation "Bioinformatique intégrative : principes et mise en œuvre sur un jeu de données multi-omiques" (ETBII 2026), au CAES de Fréjus (83). Pendant cinq jours, une vingtaine de participants et une dizaine de formateurs se sont réunis autour d’un programme riche et varié, alliant théorie, pratique et collaboration, pour en ressortir avec des compétences renforcées sur l’intégration de données omiques et l’analyse de données multi-omiques.
Formation ETBII - participants et formateurs de l'édition 2026
Après les éditions 2023 et 2024, la formation ETBII 2026 s’inscrit pour cette 3ᵉ édition comme une offre rare dans le champ de la bioinformatique intégrative. Les participants ont salué la richesse des contenus, couvrant des méthodes clés comme l’analyse multivariée, l’analyse de réseaux et le web sémantique. Ces approches, parfois complexes pour les débutants, ont été rendues accessibles grâce à une pédagogie adaptée, permettant à chacun d’acquérir rapidement une vision globale et opérationnelle des enjeux liés à l’intégration de données biologiques. Pour lire la suite

Le dernier BioStream de la saison s'est tenu le mercredi 3 juin où nous avons parlé de JOBIM avec Anna-Sophie Fiston-Lavier, Sandra Dérozier, Valérie Cognat et Isabel Alves.

Au cours des mois d'avril et mai, nous avons également proposé deux émissions dédiées à la bioinformatique au service de la lutte contre les maladies rares. Nous avons d'abord accueilli Anaïs L'Haridon et Diane Roy pour échanger autour de SeqOIA et du diagnostic des maladies rares, avant de consacrer une seconde émission aux enjeux de la recherche biomédicale avec Marie de Tayrac et Wilfrid Carré.

Biostream d'avril, mai et juin !

Mais on ne vous abandonne pas pour autant ! Vous pourrez retrouver la première partie de notre workshop annuel en live le lundi 29 juin au matin !

Si vous avez raté les émissions en direct, les rediffusions sont disponibles sur notre chaîne youtube.

L'équipe Biostream : Benjamin Loire, Elisabeth Hellec et Magis Papail

Juin
(C) 22-24/06 : Galaxy Community Conference 2026 (GCC), Clermont-Ferrand, France
(W) 29/06 : JeBIF@JOBIM , Strasbourg, France
(W) 29-30/06 : REBIF2026, Strasbourg, France
(C) 30/06-03/07 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM2026), Strasbourg, France

Septembre
(F) 21-25/09 : Computational Systems Biology of Cancer 9th edition - Generative artificial intelligence and network modelling for cancer diagnosis and treatment, Paris, France

Octobre
(F) 12-16/10 : Galaxy Beyond Basics: Mastering Workflows, Automation, and Scalability - pré-inscription jusqu'au 3 juillet - à Paris
(C) 15-16/10 : 20 ans du GDR BIMMM, Paris, France

Novembre
(F) 15-20/11: Ecole de bioinformatique niveau 1 (EB3I), Roscoff, France

Janvier 2027
(C) 27-29/01 : Paris Neuro-Oncology Conference, Paris, France

Tout au long de l'année
(F) IFB : lien vers les formations
(F) ELIXIR : lien vers les formations européennes

(C) Conférences, (F) Formations, (W) Workshops, (H) Hackathon