Bonne nouvelle :
Le comité d’évaluation de la Mission pour les initiatives transverses et interdisciplinaires du CNRS (MITI) a confirmé en février l’intégration de MERIT aux réseaux de la MITI, avec une phase d’incubation d’une durée d’un an. Le comité de pilotage MERIT, aidé des responsables des différents groupes de travail et des réseaux locaux, va donc travailler cette année à améliorer la structuration du réseau et de ses activités pour viser une pérennisation au sein de la MITI. Dans ce cadre, une réunion du réseau en présentiel est d’ores et déjà prévue en marge de JOBIM à Strasbourg en juin.

L'arrivée du printemps marque le retour des cerisiers en fleurs et de plusieurs journées annuelles des Groupes de Travail du GdR.

Le GT MASIM, dédié à la bioinformatique structurale, ouvrira le bal les 24 et 25 mars à Paris (Jussieu) avec un programme alléchant qui fait la part belle aux apports de l'IA.

Le GT Bioss, dédié à la biologie systémique et symbolique, prendra le relais les 1er et 2 juin à Paris, avec notamment un atelier thématique sur la modélisation multi-échelle à la suite de la journée annuelle. N'hésitez pas à vous inscrire et à soumettre un résumé.

En parallèle, l'école (JC)²BiMMM reprendra ses quartiers à Forges-les-Eaux pour une nouvelle édition dédiée aux fondements statistiques, algorithmiques et combinatoires pour l’analyse des grandes masses de données de séquences. Ouverte à tous les niveaux, cette école est un lieu d’échanges interdisciplinaires. Quelques places sont encore disponibles pour les retardataires (inscriptions avant le 27 mars à midi).

Enfin, n'oubliez pas de réserver les 14, 15 et 16 octobre dans vos agendas, avec la journée JCJC sur le thème « L’ADN dans tous ses états » le 14 octobre, couplée avec la célébration des 20 ans du GdR BiMMM les 15 et 16 octobre à Paris (plus d'informations à venir).

En préparation depuis plusieurs mois, le nouveau site internet est bientôt terminé ! La structure du site a été repensée (Python 2 - WordPress), pour passer à une nouvelle architecture plus moderne et facile à étendre (Python 3 - Django) !

Vous y retrouverez des informations sur l’association, nos activités et des ressources autour de la bioinformatique. Ce nouveau site vise à avoir une place centrale dans le futur, pour ouvrir les projets de l’association aux bénévoles hors de Discord et offrir une vitrine des initiatives de JeBiF !

Découvrez les nouveautés sans attendre, et n’hésitez pas à nous partager vos suggestions pour continuer à améliorer la plateforme !

La Galaxy Community Conference 2026 (GCC2026), l’événement phare de la communauté Galaxy, co-organisé par l’Université Clermont Auvergne (UCA), l’Institut Français de Bioinformatique (IFB/ELIXIR-FR) et Johns Hopkins University, se tiendra du 22 au 24 juin 2026 à Clermont-Ferrand (63), suivie du CoFest les 25 et 26 juin.

Cet événement international réunira chercheurs, ingénieurs, développeurs et responsables de plateformes de la communauté Galaxy, autour des enjeux de la science ouverte et de l’analyse de données massives en sciences de la vie.
Pour en savoir plus

L'une des missions que s'est donnée la SFBI est de mettre à disposition un système de publication des offres d'emploi, stage et thèse en bioinformatique principalement, mais également en statistiques, informatiques, mathématiques.

Pour l’année 2025, 682 annonces ont été postées, dont 269 stages (majoritairement niveau Master 2), 79 thèses et 319 offres d'emploi.

Les tendances marquantes de l'année sont les suivantes :

• analyse de séquençage toujours dominante (génomique, transcriptomique) ;
• montée en puissance de l'IA et du deep learning depuis 2022 ;
• 95,5 % des offres en France, avec une forte concentration en Île-de-France (53,8 % à Paris) et des pôles régionaux en Occitanie et Auvergne-Rhône-Alpes ;
• baisse du volume global des offres d'emploi, marquée par une diminution notable des postes de post-doctorants (tendance amorcée en 2024) et des postes d'ingénierie, qu'ils soient permanents ou temporaires.

Suite au bilan annuel des offres d'emploi postées sur le site web de la SFBI, nous aimerions comprendre un peu mieux à quoi est dûe cette diminution et nous avons besoin de vous ! Si vous êtes recruteur, merci de prendre 1 minute pour remplir ce très court sondage.

Rendez-vous sur le site de la SFBI pour un bilan plus détaillé.

Déjà 101 offres en ligne pour 2026 au 10 mars !

Nous espérons que chaque offre a trouvé ou trouvera un·e candidat·e. Bonne recherche à tou·te·s !

JeBIF est l'association des Jeunes Bioinformaticien-ne-s de France (RSG France - JeBiF). Elle est rattachée au Student Council international de l’ISCB, et a plusieurs missions, parmi lesquelles :

• Rassembler les jeunes acteur-rice-s de la bioinformatique,
• Promouvoir la communauté bioinformatique auprès des institutions publiques et des entités privées (échelles nationale et internationale),
• Informer et vulgariser la bioinformatique et les sciences auprès des étudiant-es, des professionnel-les et du grand public.

Comme chaque année, un nouveau bureau a été élu pour porter ces missions.

Pour vous donner quelques idées des projets déjà réalisés par JeBIF en 2025, qui seront de nouveau menés en 2026 :

• BioStream : des lives autour de la bioinfo sur Twitch ou Youtube. L’objectif : découvrir de chez soi des thématiques de recherches, des parcours de bioinformaticien-ne-s, ou des projets de recherche ! Au total, 10 émissions sont accessibles en rediffusion sur youtube (https://www.youtube.com/@RSGFranceJeBiF/streams) !

• JeBiF@JOBIM : l'occasion de nous retrouver entre (jeunes) bioinformaticien-nes avant JOBIM sous la forme de table ronde ou de hackathon.

• La fête de la science : vulgarisation de la bioinformatique pour un large public. Chaque année, nous innovons pour proposer de nouveaux ateliers bioinfos jeunes curieux et curieuses d’en apprendre plus sur la science. L’année dernière, nous avons animé un stand pour enquêter sur les virus, “sont-ils intelligents ?”.

• Les JobFair: pendant les journées de conférence de JOBIM, nous organisons des temps d’échanges dédiés entre les jeunes membres de la communauté et les professionnel-les du milieu intéressé-es par d’éventuels recrutements.

• Nos tables rondes : nous organisons des tables rondes au sein de formations pour discuter du monde du travail ou des possibilités de poursuites professionnelles après le master en bioinformatique.

• JeBiF PUB : l’occasion pour les membres de JeBiF et toute personne intéressée de se rencontrer, de discuter avec les bioinformaticien-ne-s de sa ville.

Si ces projets vous intéressent, ou que vous souhaitez en initier d’autres, n’hésitez pas à nous rejoindre en tant que bénévoles, et à rejoindre notre salon Discord, ou nous contacter par mail.

Le groupe de travail MERIT « reconnaissance du métier de bioinformaticien », conjointement avec la SFBI, a lancé une grande enquête sur les conditions de travail des bioinformaticiens.nes. Vous avez jusqu’au 31/03/2026 pour y répondre si ce n’est pas déjà fait ! Aidez-nous à disposer d’une vision précise des conditions professionnelles dans lesquelles se déroulent vos activités de bioinformatique, et de leurs évolutions récentes !

Madbot est disponible !
L’ouverture de madbot, annoncée en avant-première lors du All-Hands IFB/ELIXIR-FR début décembre 2025, est désormais accessible à la communauté scientifique. Chercheurs et acteurs de la recherche peuvent désormais explorer, tester et utiliser madbot afin d’organiser, orchestrer et publier au mieux leurs données scientifiques de manière plus simple et efficace. Vous pouvez également voir le replay du Biostream des Jebif spécial madbot qui a eu lieu en janvier !
Pour en savoir plus, consultez l'actualité sur le site internet de l'IFB !

Nous enrichissons notre panel d’illustrations des métiers de la bioinformatique en vous proposant :

• une nouvelle fiche métier de Théo Gauvrit, co-fondateur et Directeur Technique de la startup Vitidrone, analyse la santé des vignobles à partir de données collectées par des drones autonomes. Entre stratégie commerciale, recherche de financements et développement technique, il collabore avec des biologistes spécialisés en physiologie végétale et des informaticiens. Il souligne l'importance des compétences transversales et de la capacité à faire le lien entre disciplines.

• une nouvelle interview "De la génétique bactérienne aux bioréacteurs : quand la bioinfoinformatique rencontre la microbiologie" avec Etienne Dervyn, chargé de recherche en microbiologie au sein de l’institut MICALIS et Cyprien Guérin, ingénieur de recherche en bioinformatique au sein de l’Unité de Recherche Mathématiques et Informatique Appliqués du Génome à l'Environnement (MaIAGE). Ils partagent avec nous l'histoire de leur collaboration et notamment comment de la génétique bactérienne ils en sont arrivés à la conception de mini-bioréacteurs.

Bonne lecture à vous, et si vous êtes intéressés par la diffusion de votre vision de votre métier, n’hésitez pas à nous contacter.

Cette année encore, JeBIF se prépare pour favoriser les rencontres entre les jeunes membres de la communauté bioinformatique, pendant les JOBIM.

JeBIF vous donne rendez-vous pour son workshop annuel “JeBIF@JOBIM”, durant lequel les membres de la communauté échangent sur des sujets d’intérêt. Cette année il aura lieu le lundi 29 juin 2026, et s’intéressera particulièrement à la place des jeunes bioinfos dans le monde professionnel.

En plus de ce workshop, JeBIF – avec le soutien de la SFBI et du comité local d’organisation des JOBIM – renouvelle également les JobFair. C’est une occasion unique pour les jeunes bioinfos et les professionnel-les du domaine, pour échanger ensemble pendant les JOBIM et s’informer sur les besoins et les modalités de recrutement.

Pour plus d’informations sur ces deux évènements, et se tenir au courant des actualités, n’hésitez pas à nous rejoindre sur Discord et LinkedIn.

Les groupes de travail ont été actif en ce début d'année !

• Le GT « intégration de données hétérogènes » a proposé de répondre à la question : « How integrating multi-omics and multimodal data? », au travers du webinaire d’Anthony Baptista. Replay et support disponibles sur la page du GT.
• Le GT "FAIR et reproductibilité" a organisé son premier webinaire dédié à "La reproductibilité avec Galaxy en 2026", présenté par Gildas Le Corguillé. Support de présentation disponible.
• Le GT « Single cell et Transcriptomique Spatiale » a proposé 2 webinaires : « muscadet: An R Package for Detecting Somatic Copy Number Alterations from Single-Cell Multiomics »par Marie Denoulet et « Reproductibilité non arbitraire du clustering de données omiques » par Christophe Le Priol. Supports de présentation disponibles.
• Le GT « Long reads » a invité Anna-Sophie Fiston-Lavier pour un webinaire sur : « Evolutionary genomics of the Aedes aegypti mosquitoes in the West indies: impact of transposable elements in their Adaptation »

Outre les listes de diffusion spécifiques aux GTs, des canaux TCHAP thématiques sont également ouverts. N’hésitez-pas à les rejoindre pour participer aux discussions !

Dans le cadre du PEPR ATLASea, le projet BYTE-Sea, piloté par l’Institut Français de Bioinformatique (IFB/ELIXIR-FR), est chargé de la mise en place de l’infrastructure numérique et du développement des interfaces permettant d’accéder aux données génomiques produites par ATLASea, d’en suivre l’avancement et de faciliter leur exploitation par la communauté scientifique.

Pour en savoir plus sur ce projet qui permettra un accès aux connaissances du futur Atlas des génomes marins, regardez le reportage qui lui est consacré !

Les BioStreams sont des émissions en direct abordant des sujets variés, mais toujours d’intérêt pour toute la communauté bioinformatique. Ces lives ont lieu chaque premier mercredi du mois, et sont disponibles en rediffusion sur notre chaîne Youtube !

Mercredi 4 mars, nous avons discuté des plateformes de bioinformatique, avec Erwan Corre (plateforme ABiMS du CNRS), Edouard Hirchaud (plateforme NGS de l’Anses) et Damien Hinsinger (plateforme EPGV de l’INRAE)

Mercredi 4 février, la bioinformatique marine était à l’honneur avec Jérémy Le Luyer (Ifremer) et Nicolas Henry (plateforme ABiMS du CNRS).

Mercredi 14 janvier, nous avons découvert et vu en pratique le nouvel outil de gestion des données et des métadonnées madbot, avec trois membres de l’IFB : Baptiste Rousseau, Imane Messak, et Elora Vigo.

Prochaine émission sur les Maladies rares !

L'équipe Biostream : Benjamin Loire, Elisabeth Hellec et Magis Papail

Comme vous le savez sans doute, la SFBI propose des bourses de voyage pour soutenir vos participations à des congrès ou des formations. En 2025, la SFBI a subventionné 24 bourses de voyage pour un total d'environ 12k€, dont 13 concernaient la participation à JOBIM, 7 la participation à des formations et workshops en métropole et dans les DROM-COM et enfin, 6 la participation à des congrès internationaux tels que la conférence GIW XXXIV ISCB-Asia 2025 à Hong Kong, le congrès ESEB 2025 à Barcelone, le congrès ICOP/ISOP 2025 à Séoul ou encore WaterMicro2025 aux Pays-Bas.

Par ailleurs, la SFBI soutient également l'organisation d'évènements autour de la bioinformatique. Comme chaque année, cela a été le cas pour les Montpellier Omics Days organisés par les étudiants de l'université de Montpellier. La SFBI a également soutenu l'événement annuel du réseau de BIOinformaTIque en ProvenCe (BIOTIC) ainsi que le séminaire annuel de BioInfoDiag. La SFBI a apporté son soutien à l'organisation de l'ANF METABIODIV mais également aux Journées du Réseau National de la Recherche Reproductible 2025. Dans le cadre de JOBIM2025, la SFBI a soutenu le mini-symposium « AI in Healthcare: From Fundamentals to the Clinic » ainsi que l'événement JeBiF@JOBIM 2025.

Si vous aussi vous avez des envies de voyage, ou d'organisation d'évènements, n'hésitez pas à nous contacter, nous pourrions bien vous soutenir. Plus d'informations sur le site web de la SFBI : https://www.sfbi.fr/ dans la rubrique "Bourses/Prix".

Trois propositions impliquant des personnels de l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) ont été retenues pour JOBIM 2026, qui se tiendra du 30 juin au 3 juillet à Strasbourg.

Ces sessions thématiques permettront de favoriser les échanges autour de réflexions collectives et des enjeux pour la communauté bioinfo :
- Orchestration des flux de données - Orchestrer les flux de données tout au long de leur cycle de vie - organisé par l'IFB.
- Annotation structurale - L’annotation structurale des gènes dans les génomes eucaryotes est-elle toujours une problématique ? - co-organisé par le réseau CNRS MERIT, le réseau INRAE PEPI IBIS.
- Réseaux bioinformatiques - Interactions internationales en bioinformatique autour des technologies de séquençage - co-organisé par la SFBI, l'IRD et WAVE.

Nous remercions le comité des programmes et les organisateurs. Rendez-vous à Strasbourg fin juin !

La nouvelle année 2026 a commencé, et les bonnes habitudes ont déjà repris à JeBIF. Deux JeBIF Pubs ont été organisés, pour offrir un moment convivial à la jeune communauté bioinformatique. Merci à tou·tes les participant·es !

A Paris le 24 février

A Brest le 6 Mars

Mars
(H) 11-13 : nf-core Hackathon, Brest, France
(W) 24-25 : Journées MASIM 2026, Paris, France
(F) 29/03-03/04 : École Thématique de Bioinformatique Intégrative IFB (ETBII), Fréjus, France

Avril
(W) 29-30 : First International Workshop on Molecular Data Storage, Rennes, France

Mai
(C) 04-08 : Mathematical and Computational Evolutionary Biology (MCEB), Heraklion, Greece
(W) 26-29 : Modular composition and analysis of biological models, Marseille, France

Juin
(W) 01-02 : Journées annuelles 2026 du GT Bioss, Paris, France
(F) 01-05 : École Jeunes Chercheuses et Jeunes chercheurs du GDR BIMMM: Fondements statistiques, algorithmiques et combinatoires pour l’analyse des grandes masses de données de séquences, Forges-les-Eaux, France
(C) 09 : 4th Nancy Computational Structural Biology Symposium (NCSB), Nancy, France
(W) 02-05 : Decoding Allostery in Protein-Nucleic Acid Complexes: The AI Revolution, Paris, France
(C) 25: 4ème Journée Ifremer du microbiome, Nantes, France
(W) 29-30 : REBIF2026, Strasbourg, France
(C) 30/06-03/07 : Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM2026), Strasbourg, France

Juillet
(C) 01-03 : Levures, Modèles et Outils, Montpellier, France
(C) 06-10 : MESS 2026 - Metaheuristics Summer School
~ Emerging Computing Paradigms for Optimization:
from Quantum to Neuromorphic ~, Catania, Italy
(C) 13-17 : The Genetic and Evolutionary Computation Conference (GECCO 2026) and the student workshop call for papers, San José, Costa Rica & remote

Septembre
(C) 22-25 : The German Conference on Bioinformatics (GCB) 2026, Saarbrücken, Germany

Octobre
(F) 12-16/10 : Formation GALAXY avancée - pré-inscription en avril - à Paris
(W) 14-16 : Journée JCJC sur le thème « L’ADN dans tous ses états », couplée avec la célébration des 20 ans du GdR BiMMM, Paris, France

Novembre
(F) 15-20/11: Ecole de bioinformatique niveau 1 (EB3I), Roscoff, France - pré-inscription en cours

Tout au long de l'année
(F) IFB : lien vers les formations
(F) ELIXIR : lien vers les formations européennes

(C) Conférences, (F) Formations, (W) Workshops, (H) Hackathon