Réunion MERIT en marge de l’AG All-hands 2025 de l’IFB

Le 2 décembre 2025, le comité de pilotage du réseau MERIT s’est réuni avec les animateurs et animatrices des groupes thématiques pour effectuer un bilan des actions 2025 et préparer les projets 2026, notamment dans le cadre de l’intégration à la MITI du CNRS.

Bilan et perspectives des formations 2025

• ANF « Workflow et reproductibilité » : La première Action Nationale de Formation, co-organisée par le réseau MERIT, l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) et l’Université Paris Cité s'est déroulée du 25 au 27 novembre 2025. Les retours des 20 participant·e·s sont très positifs, vous pouvez trouver les supports sur Moodle de l'IFB. Une nouvelle ANF sur cette même thématique pourrait être organisée en 2027.

• IAbioscripting : Cette formation organisée le 13 juin 2025 sur l’utilisation des IA génératives pour la programmation et le scripting a connu un succès exceptionnel avec près de 100 candidatures. Une nouvelle édition en 2026 est à l'étude.

Actualités des groupes thématiques (GT)

• FAIR : Suite à l'engouement autour de l’ANF, le GT réfléchit à de nouvelles actions, notamment des webinaires.

• Single-Cell et Intégration de Données Hétérogènes : Une journée commune est prévue en présentiel en 2026 associant théorie et mise en pratique.

• Long Reads et Annotation : Des webinaires ainsi qu'un mini-symposium sur l’annotation structurale pour JOBIM 2026 sont en préparation, avec une possible collaboration du PEPI IBIS.

• IA : Le GT continue d'organiser des webinaires et réfléchit à une nouveau IAbioscripting.

• Métier : Un sondage sur les conditions de travail des bioinformaticien·ne·s, en lien avec la SFBI, sera diffusé en janvier 2026. Les résultats seront présentés à JOBIM 2026.

Soutien financier des réseaux locaux

Dans le cadre de ses missions, MERIT soutien les réseaux locaux et leurs actions, un budget y est dédié. Déjà deux sollicitations de la part des réseaux MBI et BIOTIC, n'hésitez pas à contacter le bureau MERIT pour bénéficier d'un soutien.

Comme vous l’avez toutes et tous déjà noté, JOBIM 2026 pose ses valises à Strasbourg du 30 Juin au 3 juillet 2026. Pour ne rien louper, rendez-vous sur http://jobim2026.sfbi.fr/.

L’appel à mini-symposiums a été lancé avec une date limite de soumission fixée au Mercredi 21 Janvier 2026 à 18h (envoi des propositions à itavaresalves@unistra.fr).

Pour rappel, les mini-symposiums (durée : 2-3 heures) réunissent des scientifiques autour de thématiques spécialisées en bioinformatique afin de favoriser les échanges autour de sujets émergents, interdisciplinaires ou particulièrement dynamiques en bioinformatique et biologie computationnelle. Ils doivent s’autofinancer et un engagement financier vous sera demandé au moment de la soumission (une enveloppe de soutien à l’organisation pourra être octroyée par la SFBI).

Vous manquez d’inspiration, n’hésitez pas à consulter les symposiums organisés les années précédentes (2022, 2023, 2024 et 2025).

Restez attentifs en début d’année, l’appel à contributions orales puis l’appel à posters ne tarderont pas.

Au plaisir de vous voir nombreux à Strasbourg en 2026 !

Le principe du JeBiF Pub est simple : offrir un moment convivial pour la communauté bioinformatique afin de discuter, échanger des idées, développer des contacts professionnels, ou tout simplement rencontrer d’autres bioinformaticiens de sa ville !

• PARIS: Jeudi 4 décembre à partir de 18h30
  
• MARSEILLE: Lundi 24 novembre dès 19h
  
• PARIS: Jeudi 23 octobre à partir de 18h30
  

Lancé début 2025, le projet de refonte/création du nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR atteint aujourd’hui l’une de ses étapes cruciales : sa publication  !

Ce beau projet est essentiel pour l’IFB et avant tout pour la visibilité de nos missions, services et plateformes, au bénéfice de nos communautés scientifiques.

Pensé pour être plus clair, plus accessible et plus attractif, le nouveau site présente l’expertise de l’IFB/ELIXIR-FR, tout en offrant une expérience de navigation optimisée.

Ce nouveau site répond aux objectifs que l’on s’était donné :
- Proposer un design moderne, une navigation plus intuitive et une expérience utilisateur nettement améliorée.
- Offrir une meilleure mise en valeur des services, qu’il s’agisse de nos infrastructures numériques, des plateformes ou encore des formations, outils et bases de connaissances.
- Viser un accroissement de notre rayonnement européen grâce au multilinguisme et à la nouvelle URL https://www.ifb-elixir.fr/
- Faciliter l’accès aux ressources et donner davantage de visibilité à nos actualités.

Pour toutes ces raisons, nous sommes heureux de vous présenter cette nouvelle vitrine de l’IFB/ELIXIR-FR !

La suite ? À compter de 2026, une phase version2 débutera pour affiner les contenus techniques avec nos différentes équipes. Une alimentation régulière par nos plateformes et la poursuite d’une mise à jour globale du Catalogue de l’IFB viendront également étayer cette version2.

Vous avez une suggestion à proposer  ? Contactez-nous via le formulaire.

Les journées du GdR BiMMM et de trois de ses Groupes de Travail (SeqBIM, StatOmique et LEGO) se sont tenues à Nantes du 24 au 28 novembre. Cette édition a rassemblé 170 inscrit·e·s (toutes journées confondues) et a permis de croiser les publics des différents GTs. Un immense bravo aux comités de programme et d’organisation des différentes journées pour le travail fourni et la réussite de ces journées. Nous leur souhaitons de profiter des fêtes de fin d’année pour se reposer.

Mais le repos sera visiblement de courte durée pour nos braves. L’année 2026 du GdR commencera avec la journée satellite du GT Statomique (28 janvier 2026) qui mettra à l’honneur les grenoblois·e·s et l’édition 2026 de l’école JC2BiMMM (1 au 5 juin 2026, inscriptions ouvertes) qui reprendra ses quartiers à Forge-les-Eaux. Enfin, le GdR BiMMM fêtera en octobre un anniversaire un peu spécial, mais un peu de patience, on vous en dira plus au prochain numéro.

Le comité d'organisation de JOBIM2025 a analysé l'empreinte carbone du congrès JOBIM 2025 à Bordeaux que vous pouvez consulter ici.

Celle-ci s’élève à environ 30 tonnes CO2e. L’impact majeur provient des voyages (71 %) et principalement du transport aérien (80 % des émissions liées aux déplacements) pour seulement 25 trajets.

Parmi les initiatives positives, le choix d'une restauration végétarienne a permis une économie d'environ 2,4 tonnes CO2e par rapport à une option omnivore, une décision bien accueillie par 82 % des participants.

En conclusion, réduire les voyages aériens reste une priorité. Le rapport suggère également d'explorer des formats alternatifs (multi-sites, en ligne, alternance), de privilégier les repas végétariens, de systématiser le calcul de l'empreinte carbone et de communiquer largement.
Les conférences représentent une part importante et visible de l'empreinte carbone globale et, en plus des achats et des activités de recherche elles-mêmes, réduire l'impact de la recherche implique d'aller vers des événements plus durables.

Enfin, JOBIM 2025 a accueilli ce mini-symposium qui a abordé la question de la réduction de l'empreinte carbone dans nos pratiques bioinformaticiennes.

Les biostreams sont de retour pour une nouvelle saison !

Mercredi 3 décembre, nous avons eu le plaisir d'accueillir Yann Chovory ainsi que Antoine Trehello, bioinformaticiens à l'IGNA (Institut Génétique Nantes Atlantique).

Durant cette émission nous avons parlé:

• du rôle de la bioinformatique en Police Scientifique (résolution de cold cases, portrait-robot génétique, généalogie génétique, métagénomique)

• des différentes voies de spécialisation possibles

• de leurs retours d’expérience dans le domaine

L'émission est accessible en rediffusion ici : https://www.youtube.com/live/Jauuv90POc8?si=ZCHIIl4shlosIYew

Prochain RDV le mercredi 7 janvier à 19H30 !

L'équipe Biostream

L’année 2025 a été marquée par une dynamique forte autour des formations organisées par l’Institut Français de Bioinformatique (IFB) / ELIXIR France. Intelligence artificielle, workflows reproductibles, analyse de données omiques, et sous différents formats: tutorat BYOD, cours, ateliers, ... Ces 9 formations ont rassemblé une communauté scientifique variée, en recherche d’expertises pratiques et d’échanges interdisciplinaires.

Pour découvrir le retour sur l’ensemble de nos formations et le planning des prochaines formations, consultez l’article sur le nouveau site internet de l’IFB/ELIXIR-FR !

JeBiF tiendra son Assemblée Générale Ordinaire du 19 au 22 décembre 2025. Ce sera l’occasion de renouveler le Conseil d’Administration et le Bureau, de voter les bilans 2025 et de découvrir les projets à venir.

Vous souhaitez vous impliquer ou en savoir plus sur JeBiF ? L’AG est le moment idéal pour poser vos questions.

Intéressé·e pour rejoindre le CA ? Envoyez votre profession de foi à contact@jebif.fr
avant le 18 décembre.

Dates importantes :
- 19 décembre : ouverture de l’AG
- 19–22 décembre : votes
- 22 décembre : clôture et résultats

Le site web de la SFBI est une des vitrines de la Bioinformatique en France : https://www.sfbi.fr/. Vous y trouverez notamment des liens vers les principaux acteurs de la communauté bioinformatique française qui constituent le réseau de la SFBI.

Une des actions phare de la SFBI est la diffusion des offres d’emploi dans le domaine de la bioinformatique (du stage au poste permanent en passant par les thèses de doctorat et les contrats à durée déterminée). Vous les retrouverez directement sur notre site web mais également sur la liste de diffusion attitrée : emplois@sfbi.fr.

En parlant de liste, connaissez-vous la liste bioinfo@sfbi.fr ? C’est LE lien virtuel de la communauté Bioinformatique française à ne pas louper ! Elle permet de recevoir par email toutes les informations qui touchent notre communauté : les écoles thématiques, les conférences, les thèses et les HDR, …

Si vous voyez passer un événement d’intérêt sur la liste bioinfo@sfbi.fr et que vous souhaitez y participer, peut-être êtes-vous éligibles à une bourse de voyage SFBI ? Elle peut vous aider à financer votre hébergement ou votre déplacement à hauteur de 500€. Et si vous êtes plutôt du côté des organisateurs que des participants à un événement, n’hésitez pas à diffuser l’information sur la liste en vous y abonnant et à demander une bourse pour l’organisation de votre événement. Ce soutien de 500€ pourrait vous aider à financer une pause café ou un déplacement d’orateur.

Pour que toutes ces actions perdurent, n’hésitez pas à soutenir la SFBI via une adhésion à titre individuelle ou au titre de votre laboratoire, unité, équipe de recherche, plateforme via une adhésion Personne morale.

En plus du site web, n’hésitez pas à nous suivre sur LinkedIn, BlueSky et Mastodon !

Cette nouvelle édition du All-hands IFB-ELIXIR-FR s’est déroulée du 2 au 4 décembre 2025 à l’Institut des systèmes complexes en présence des représentants de nos plateformes membres, contributrices et équipes associées, ainsi que l’ensemble des équipes de l’IFB-core. Pour cette nouvelle édition, nous avons eu le plaisir d’accueillir le Scientific Advisory Board (SAB) de l’IFB.
Photo de groupe All-hands 2025 IFB/ELIXIR-FR
Pour en savoir plus, rendez-vous sur le site internet de l'IFB/ELIXIR-FR

Janvier

• (C) 29-30: Statistical Methods for Post-Genomic Data (SMPGD) 2026, Grenoble, France

Février

• (F) 09-13: AI-Accelerated Design and Optimisation of Compounds for Biological Applications, Paris, France

Mars

• (W) 17-20: Stochastic differential equations and the YUIMA R package (Simulation
  and Inference for SDEs and Other Stochastic Processes), Linköping University, Sweden
• (C) 17-19: Constraint-Based Reconstruction and Analysis (COBRA2026), Potsdam, Germany
• (F) 23-27: Qlife Winter School: Quantitative Approaches to DNA Damage and Repair, Paris, France
• (F) 29/03-03/04: École Thématique de Bioinformatique Intégrative IFB (ETBII), Fréjus, France

Juin

• (F) 01-05: École Jeunes Chercheuses et Jeunes chercheurs du GDR BIMMM: Fondements statistiques, algorithmiques et combinatoires pour l’analyse des grandes masses de données de séquences, Forges-les-Eaux, France
• (C): 30/06-03/07: Journées Ouvertes en Biologie, Informatique et Mathématiques (JOBIM2026), Strasbourg, France

Tout au long de l'année

(F) IFB : lien vers les formations
(F) ELIXIR : lien vers les formations européennes
(F) SIB courses : lien vers les formations

(C) Conférences, (F) Formations, (W) Workshops

Tips: Renseignez vos événements sur le site de la SBFI via votre profil et diffusez-le automatiquement sur la liste bioinfo@sfbi.fr